汕头地区汉族人群17个STR基因座遗传多态性

2016-02-13 01:08方雅丽
广东公安科技 2016年4期
关键词:基因座法医学汕头

方雅丽 周 婷

(汕头市公安局刑警支队刑事技术中心,广东汕头515011)

汕头地区汉族人群17个STR基因座遗传多态性

方雅丽 周 婷

(汕头市公安局刑警支队刑事技术中心,广东汕头515011)

本文通过收集汕头市712份汉族无关个体FTA血样,对17个STR基因座遗传多态性,进行基因型检测,并计算其遗传学参数。调查显示,汕头地区汉族人群17个STR基因座H为0.566~0.904,DP为0.744~0.984,PE为0.333~0.923,PIC为0.50~0.90,累积个体识别能力(CDP)为1~6.6434×10-21,累积非父排除率(CPE)为0.999999975201。汕头地区汉族人群17个STR基因座有较高的鉴别能力,为法医个体识别和亲缘鉴定提供了基础数据。

法医物证学STR基因座遗传多态性汕头地区

根据基因、人类学和史学调查研究,潮汕人群是典型的中国南方汉族群体,现代潮汕人源自古中原汉族,主要是自秦汉以来大量的中原汉族移民与南方土著居民杂居后形成的[1][2]。本文对汕头地区汉族群体D3S1358、Penta E、D18S51、D16S539、TH01、vWA、FGA、TPOX、D19S433、D5S818、D8S1179、CSF1PO、D7S820、D6S1043、D13S317、D2S1338、D21S11等17个STR基因座遗传多态性进行调查,为法医个体识别和亲缘鉴定提供了基础数据。

1 材料与方法

汕头市712份汉族无关个体FTA血样,来源于汕头市公安局DNA数据库样本。采用BSD QP自动打孔机取样本,美国Promega公司的PowerPlex®18D System试剂盒在9700型扩增仪上对17个STR基因座进行复合扩增。PCR扩增体系为10μL,PCR产物在ABI 3130XL型基因分析仪上电泳检测。结果由Gene Mapper ID v 3.2软件进行分析。用直接计数法计算各基因座的基因型和基因频率,利用Power stats和PIC Calc 0.6软件获得各基因座的杂合度(H)、个体识别能力(DP)、非父排除率(PE)、多态信息含量(PIC)等参数,采用精确检验法[3]进行Hardy-Weinberg平衡检验。

2 结果与讨论

汕头市汉族无关个体17个STR基因座等位基因及其分布频率见表1。经检验,P值均大于0.05,符合Hardy-Weinberg平衡定律。各基因座的群体遗传学参数见表2。

在17个STR基因座中,H为0.566~0.904,DP为0.744~0.984,PE为0.333~0.923,PIC为0.50~0.90,由此计算出17个基因座的累积个体识别能力(CDP)为1~6.6434×10-21,累积非父排除率(CPE)为0.999999975201。Gill[4]等认为杂合度(H)大于或等于0.7和个体识别能力(DP)大于或等于0.9的基因座有较高的鉴别能力,适于法医学应用。由表2可见,除D3S1358、TH01、TPOX和CSF1PO以外,共有13个STR基因座H≥0.7,DP≥0.9,能够满足法医学应用中的亲权鉴定和个体识别的需要。

在人群比较中,发现汕头地区人群与广州地区人群的15个STR基因座均无显著性差异(P>0.05),[5]与中国汉族人群15个STR基因座的数据在CSF1PO基因座有显著性差异(P<0.05),[6]与文献7四川汉族人群19个STR基因座中D13S317、D5S818、D16S539、D8S1179、TPOX、CSF1PO、D19S433等7个基因座有显著性差异,[7]可见汕头地区的人群结构与四川地区人群有较大的差异。(如表3所示)

表1 汕头地区人群17个STR基因座等位基因频率(n=712)

12 13 14 15 16 17 18 18.2 19 20 21 22 23 24 25 26 0.0386 0.1854 0.1973 0.1959 0.1390 0.0779 0.0421 0.0007 0.0309 0.0295 0.0246 0.0176 0.0084 0.0042 0.0028 0.0007 20 21 21.2 22 22.2 23 23.2 24 24.2 25 25.2 26 27 27.2 28 29 0.0358 0.1257 0.0049 0.1756 0.0042 0.2205 0.0140 0.1742 0.0070 0.1096 0.0042 0.0316 0.0140 0.0007 0.0021 0.0014 D8S1179 A 9 1 0 F 11 12 13 14 15 16 17 18 0.0014 0.1236 0.1046 0.1096 0.2086 0.1889 0.1678 0.0836 0.0105 0.0014 18 19 20 21 21.3 0.1805 0.1404 0.0527 0.0126 0.0007 32 32.2 33 33.2 34 34.2 0.0274 0.1397 0.0056 0.0583 0.0007 0.0028

表2 汕头地区人群17个STR基因座的统计学分析(n=712)

表3 汕头地区人群与其他人群比较的P值表

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