硒蛋白S基因单核苷酸多态性与肝癌发病风险的关联性分析

2018-06-01 03:47邢少姬郑连生王殿栋
吉林大学学报(医学版) 2018年3期
关键词:易感性频数等位基因

邢少姬,郑连生,王殿栋,张 萱,池 敏

(1.包头医学院医学技术学院临床生物化学检验与分子诊断学教研室,内蒙古 包头 014060;2.内蒙古自治区包头市肿瘤医院胸腹外科,内蒙古 包头 014030;3.包头医学院第二附属医院肿瘤外科,内蒙古 包头 014030;4. 内蒙古自治区包头市肿瘤医院检验科,内蒙古 包头 014030;5.内蒙古自治区人民医院核医学科,内蒙古 呼和浩特 012000)

原发性肝细胞癌(简称肝癌)是我国的一个重要公共健康问题,全球大约一半的肝癌患者在中国[1]。现已明确我国肝癌的发生与乙型、丙型肝炎病毒感染及食物中黄曲霉素B1的摄入等环境危险因素有密切关联。但面临同样的危险因素,如粮食中的黄曲霉素B1污染,却只有少数人罹患肝癌[2],提示肝癌的发生也与宿主个体遗传因素或基因与环境的交互作用有关。目前国内已有多项研究表明宿主基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与肝癌的发病风险有关。王艳等[3]和李艳秋等[4]研究发现:白细胞介素28B(IL-28B)基因rs4803223位点和切除修复交叉互补基因1(ERCC1)8092位点多态性分别与广西汉族和壮族人群肝癌易感性有关。王维伟等[5]发现:郑州和桂林两地区人群醌氧化还原酶1(NQO1)基因型频数可能不同,但NQO1基因多态性与郑州和桂林两地区人群的肝癌易感性均可能具有关联性,且均与吸烟和饮酒存在协同作用。

硒蛋白S(selenoprotein S,SelS)为硒蛋白家族的成员之一,是一种内质网和细胞膜驻留蛋白,在人体各种组织中广泛存在,如下丘脑、肝脏、脂肪组织、睾丸、心脏和肾脏等[6],其具有抗氧化、减少细胞凋亡和抑制炎症反应等主要生理功能[7]。因此,一旦个体SelS基因发生突变,可能影响其蛋白质的抗氧化损伤和抗炎症反应等正常生物学功能的发挥,进而降低人体细胞抵御癌症发生的能力。近年来,国内外研究[8-10]显示:SelS基因启动子位点的多态性与消化系胃肠道恶性肿瘤发病有密切关联,但未见其与消化系肝癌相关性的报道。本研究旨在探讨内蒙古自治区汉族人群中肝癌患者和健康体检者SelS基因启动子rs34713741位点多态性,分析其与肝癌发生的关系。

1 资料与方法

1.1 研究对象 ①原发性肝癌组:选择2015年1月—2017年2月内蒙古自治区包头市肿瘤医院、包头医学院第一和二附属医院及内蒙古自治区人民医院收治的原发性肝癌患者96例,其中男性71例,女性25例,年龄39~81岁,平均年龄(60.32±11.20)岁;②健康对照组:来自同期社区健康体检者135人,其中男性85人,女性50人,年龄35~80岁,平均年龄(60.07±10.42)岁。所有纳入对象均对本研究知情同意,经询问病史、体检和实验室检查排除患有其他肿瘤、冠心病、糖尿病和高血压等疾病者,且无肿瘤家族史,均已在内蒙古地区居住10年以上,为无血缘关系的汉族人群。同时调查记录所有入选者的饮酒状况(本研究将饮酒者定义为现时饮酒者,指饮高度白酒每月至少4次或每周至少1次,持续半年以上)。

1.2 聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测 ①基因组DNA的提取:采集研究对象空腹静脉血2 mL于EDTA抗凝管中,严格按照基因组DNA提取试剂盒说明书提取外周血基因组DNA,-20℃保存;②引物设计与合成:SelS基因SNP rs34713741引物序列见参考文献[10],上游序列5′-CTTCCGGTGCGCTCCTAC-3′,下游序列5′-GGCGACCACTGACTTCCTT-3′,目的基因长度为 302 bp。并通过PubMed-SNP数据库查询SelS基因rs34713741两侧基因序列(NC_000015.10)的准确性,采用BLAST 软件验证引物特异性。引物由上海生工生物工程股份有限公司合成;③PCR扩增。PCR反应体系总体积为25 μL:模板6 μL(约100 ng),10 μmol-1上下游引物各1 μL,2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL,去离子水4.5 μL。PCR反应参数设置:95℃预变性5 min, 95℃变性30 s,62℃退火30 s,72℃延伸1 min,35个循环;72℃最后延伸5 min;④基因分型和测序:酶切反应总体系为20 μL,包括PCR扩增产物12 μL,内切酶HinfⅠ 2.0 μL,10×限制性内切酶Buffer 2.0 μL,去离子水4.0 μL。于37℃水浴30 min后,酶切产物于2.5%琼脂糖凝胶上电泳,采用分子凝胶成像仪分析其基因型(TT型为302 bp 1个片段,CT型为302、198和104 bp 3个片段,CC型为198和104 bp 2个片段)。为验证限制性片段长度多态性(RFLP)基因分型的准确性,随机选取50份PCR产物送至上海美吉生物北京实验基地测序,测序结果与RFLP基因分型结果一致率达100%。

1.3 统计学分析 采用SPSS 17.0统计软件进行统计学分析。2组研究对象基因型和等位基因频数比较采用χ2检验。采用非条件Logistic回归计算风险比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI),评价基因型和等位基因与肝癌发病风险的关系。检验均为双侧检验,以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结 果

2.1 SelS基因rs34713741位点RFLP基因分型 通过限制性内切酶HinfⅠ对PCR产物消化后电泳确定SelS基因rs34713741多态位点有2个等位基因C和T,可组合形成CC、CT和TT 3种基因型。见图1。

M:100 bp DNA ladder marker;Lane 1,3:TT;Lane 2,6:CC;Lane 4,5,7:CT.

图1 SelS基因rs34713741位点RFLP基因分型电泳图

Fig.1 Electrophorogram of RFLP genotypes at rs34713741 site of SelS gene

2.2 SelS基因rs34713741位点测序结果 PCR产物测序结果显示:SelS基因SNP rs34713741位点有CC、CT和TT 3种基因型,测序结果与酶切结果完全一致。见图2。

A: CC genotype; B: CT genotype; C: TT genotype; Line segment:EndonucleaseHinfⅠ recognition site; Arrow:rs34713741 site.

图2 SelS基因rs34713741位点PCR产物测序结果

Fig.2 Sequencing results of PCR products of rs34713741 site of SelS gene

2.3 2组研究对象的一般资料 健康对照组和肝癌组研究对象在年龄和性别方面匹配,组间比较差异无统计学意义(年龄:χ2=0.644,P=0.422;性别:χ2=3.094,P=0.079);肝癌组饮酒者占比高于对照组,但组间比较差异无统计学意义(χ2=2.888,P=0.089)。见表1。

表1 健康对照组和肝癌组研究对象的一般资料

2.4 2组研究对象SelS基因rs34713741位点的基因型和等位基因频数分布 为了检验研究对象SelS基因rs34713741位点多态性分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律,对健康对照组人群的基因型频数进行遗传平衡检验,结果表明:所观察的样本具有群体代表性(χ2=0.543,P=0.762)。肝癌组患者SelS基因rs34713741位点CC、CT和TT 3种基因型分布频数分布与健康对照组比较差异无统计学意义(χ2=2.679 ,P=0.262); C和T 2种等位基因频数分布组间比较差异亦无统计学意义(χ2=2.331,P=0.127)。见表2。

表2 2组研究对象SelS基因rs3471374位点基因型和等位基因频数分布

Tab.2 Distribution of genotypic and allelic frequencies at rs34713741 site of SelS gene of subjects in two groups

[n(η/%)]

2.5 2组饮酒者SelS基因rs34713741位点SNP与肝癌发病风险的关系 肝癌组和健康对照组中饮酒者CC、CT和TT基因型频数分布比较差异有统计学意义(χ2=6.533,P=0.038; OR =2.297,95%CI:1.202~4.393);等位基因C和T频数分布比较差异有统计学意义 (χ2=6.417,P=0.011; OR =1.901,95%CI:1.153~3.134)。见表3。

表3 2组研究对象中饮酒者SelS基因rs34713741位点基因型和等位基因频数分布

Tab.3 Distribution of genotypic and allelic frequencies at rs34713741 site of SelS gene of drinkers in two groups

[n(η/%)]

3 讨 论

目前研究[10]显示:与消化系肿瘤密切相关的硒蛋白SNP位点多位于基因的启动子区,该处基因的变异相比于编码区对硒蛋白表达的影响更大,更易改变个体罹患胃肠道肿瘤的风险。SelS基因定位于15q26.3,包含6个外显子和5个内含子,分别由1 250和1 292个碱基组成2个转录变体,最终编码产物均为由189个氨基酸残基组成的SelS,其中第188位是硒代半胱氨酸残基[11]。目前国内外研究最多的是位于基因启动子区的rs28665122和rs34713741位点。研究[12]显示:SelS基因rs28665122位点 SNP可调节SelS的表达,并对促炎性细胞因子的释放产生影响。Meplan 等[9]发现:捷克人群SelS基因rs34713741位点SNP与结直肠癌的发病有关联,TT纯合子个体的患病风险是CC纯合子个体的1.68倍。毛华杰等[8]和张龙等[10]针对SelS基因启动子区rs34713741位点SNP与胃肠道癌症遗传易感性的相关性研究发现:SelS基因rs34713741位点SNP与结直肠癌和胃癌的发病有关,T等位基因可能是中国人群胃肠癌发病的危险因素之一。本课题组研究[13]显示:SelS 基因 rs34713741位点SNP与内蒙古汉族人群胃癌的发病有关联,T 等位基因可能是胃癌发病的危险因素之一,同时吸烟可增加发病的风险。

本研究采用PCR-RFLP技术对96例内蒙古汉族肝癌患者及135例体检健康对照者SelS基因rs34713741位点的基因型和等位基因频数进行检测分析,结果表明:肝癌组患者SelS基因rs34713741位点CC、CT和TT 3种基因型频数分布与健康对照组比较差异无统计学意义,C和T 2种等位基因频数分布2组比较差异无统计学意义;但在肝癌组和健康对照组饮酒者中CC、CT和TT基因型频数分布比较差异有统计学意义,C和T等位基因频数分布比较差异亦有统计学意义,提示SelS基因及饮酒存在交互作用,且与肝癌的发病可能有关联。

大量饮酒是导致肝癌的危险因素之一,其机制主要涉及2个方面:首先,酒精在体内的代谢产物乙醛能与DNA形成加合物,造成DNA损伤和基因突变,对动物有明显致癌作用;其次,乙醇可诱导肝微粒体乙醇氧化途径,不仅增加乙醛浓度,也促使大量氧自由基的产生,进而作用于人体细胞基因组DNA,引起其损伤,最终导致基因突变或细胞癌变[14-15]。本研究结果显示:肝癌组饮酒者占72.9%,高于对照组(62.2%),但组间比较差异无统计学意义;可能与内蒙古自治区人群的饮酒习惯和标本量少有一定关系,同时酒的品牌、饮酒频率和酒龄等不同亦可能影响肝癌的发病,具体情况有待进一步研究。

肝癌是一种多种危险因子共同参与、相互作用的恶性肿瘤[16],一项河北省原发性肝癌易感因素的病例对照研究[17]显示:吸烟,饮酒,体质量指数(BMI)增高,常食用霉变食物、腌制食品和剩饭菜,乙肝和肝癌家族史等均是导致肝癌发病率增高的危险因素。肝癌发生也是一个受多基因、遗传与环境因素等综合影响的复杂过程,在注重遗传基因多态性识别同时,需要更加深入探讨可能存在的遗传与环境因素之间的交互作用[18]。本研究结果也进一步表明了基因与环境因素共同作用可能使个体罹患癌症的风险增加。但由于本研究所涉样本例数较少,易出现结果偏倚。在后续的研究中需继续增加样本例数,进一步对各基因型在各组中的分布进行分析,探讨其与患者性别、年龄、吸烟、家族史和乙肝病毒感染史等的相关性。

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