维生素D受体基因多态性与2型糖尿病易患性的Meta分析

2014-02-08 07:15侯清涛李舍予吕霞飞马骁潇庞才双蔡惠民严芳芳田浩明
中国全科医学 2014年27期
关键词:核苷酸多态性位点

侯清涛,李舍予,吕霞飞,马骁潇,庞才双,蔡惠民,严芳芳,李 芸,田浩明

2型糖尿病(T2DM)是糖尿病的一种重要亚型,胰岛素抵抗与胰岛β细胞功能缺陷是其基本病理生理改变。目前,T2DM的发病机制尚不明确,近年来研究表明,免疫和全身炎性反应参与T2DM的发生[1]。维生素D是体内维持钙磷代谢的基本激素,同时也是重要的免疫调节激素,影响机体的免疫功能,维生素D缺乏与众多免疫疾病密切相关[2-3]。维生素D通过调节细胞内钙离子浓度,影响胰岛素的合成与分泌;通过免疫调节,抑制全身炎症反应,减少胰岛β细胞免疫损伤,增加胰岛素敏感性[4-5]。维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)与维生素D结合,调节后者在细胞中的表达。因此推测VDR对T2DM的发生有重要调控作用。

目前,关于T2DM与VDR基因多态性的研究主要集中在ApaⅠ(rs7975232)、BsmI(rs1544410)、FokI(rs2228570)和TaqI(rs731236)4个位点[6]。但各研究间尚存有争议,因此本研究按照Cochrane系统评价的方法进行Meta分析,进一步探讨T2DM与VDR基因(ApaI、BsmI、FokI、TaqI)多态性的相关性。

1 资料与方法

1.1 文献检索 检索PubMed、EMBase、中国期刊全文数据库(CNKI)、中国生物医学文献数据库(CBM)、维普网、万方数据库从建库到2013年4月发表的中英文文献,并进行手工检索。英文数据库检索策略:(vitamin D receptor OR VDR) AND(polymorphism OR SNP OR varia*OR mutation) AND(diabetes OR diabetes mellitus[MeSH])。中文数据库检索策略:(维生素D受体 OR VDR) AND(多态性OR SNP) AND(糖尿病)。

1.2 文献纳入和排除标准 纳入标准:(1)病例对照研究;(2)病例组及对照组基因型或等位基因频率可获取;(3)对照组等位基因频率符合Hardy-Weinberg平衡(HWE)定律。排除标准:(1)重复发表;(2)摘要及全文语言非英语或中文;(3)数据无法提取。

1.3 文献质量评价 由本文的第一、第二作者独立阅读题目和摘要,对符合要求的文献详细阅读全文,遇到不同意见时,由第三作者参与讨论共同决定。文献质量评价采用观察性Meta分析的Newcastle-Ottawa Scale(NOS)量表,从病例和对照的选择、可比性、暴露3方面来量化文献的质量,0~4分者为低质量研究,5~9分者为高质量研究。

1.4 数据提取 由本文的第一、第二作者独立阅读全文,提取以下数据:文章ID、篇名、研究地区、出版年限、种族、基因分析方法、病例定义、对照人群来源、组间基线匹配情况、病例组和对照组样本量、性别构成及平均年龄、病例组发病年龄、基因位点、对照组HWE检测的P值、研究是否提及混杂因素的控制(见表1)。

1.5 统计学方法 采用Stata 12.0软件。研究间的异质性由Q检验和I2值评价,I2≤50%,选用固定效应模型;I2>50%,说明异质性较大,探索异质性来源或采用随机效应模型。运用Meta回归分析追溯潜在的异质性来源。按照种族进行亚组分析。敏感性分析评价研究结果的稳定性。Begg′s检验和Egger′s检验检测发表偏倚。Pearson′s χ2检验进行HWE检测。以P<0.05为差异有统计学意义。

2 结果

2.1 文献检索结果 最初检索到相关文献920篇,根据其题目和摘要排除872篇,进一步阅读全文后排除14篇,1篇无法获取数据。最终33篇[7-39]文献符合纳入标准进入本Meta分析。纳入文献的发表时间1999—2012年。文献筛选流程见图1。所有纳入文献,NOS量表评分均在5~9分。33篇文献共59个研究,涉及ApaI 14篇[7,9-12,20,24,28-29,32-36]文献,共5 412例,病例组2 307例,对照组3 105例;涉及BsmI 18篇[8-10,12-14,18-19,21,24-27,30,33-35,37]文献,共 6 095例,病例组2 695例,对照组3 400例;涉及FokI 13篇[12,14-17,21-25,31,34,39]文献,共 4 087例,病例组2 180例,对照组1 907例;涉及TaqI 14篇[7,9-12,24-25,28-30,32,34,37-38]文献,共5 364例,病例组2 157例,对照组3 207例。

2.2 Meta分析 去除对照人群不满足HWE检测的研究后,12篇[7,9,11-12,20,24,28-29,32-33,35-36]文献研究了ApaI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性的相关性,各研究间存在统计学异质性(P=0.000,I2=72.6%),采用随机效应模型进行Meta分析。结果显示,ApaI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性不存在相关性〔OR=0.88,95%CI(0.72,1.08),P=0.232,见图2〕。

去除对照人群不满足HWE检测的研究后,16篇[8-9,12-14,18-19,21,24-27,30,33,35,37]文献研究了BsmI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性的相关性,各研究间存在统计学异质性(P=0.000,I2=83.9%),采用随机效应模型进行Meta分析。结果显示,BsmI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性不存在相关性〔OR=1.22,95%CI(0.87,1.70),P= 0.255,见图3〕。

去除对照人群不满足HWE检测的研究后,11篇[12,14-17,21-24,31,34]文献研究了FokI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性的相关性,各研究间存在统计学异质性(P=0.001,I2=66.4%),采用随机效应模型进行Meta分析。结果显示,FokI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性存在相关性〔OR=1.31,95%CI(1.09,1.57),P=0.004,见图4〕。

去除对照人群不满足HWE检测的研究后,10篇[7,9,12,24-25,28,30,34,37-38]文献研究了TaqI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性的相关性,各研究间存在统计学异质性(P=0.002,I2=65.3%),采用随机效应模型进行Meta分析。结果显示,TaqI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性不存在相关性〔OR=1.13,95%CI(0.92,1.40),P=0.234,见图5〕。

2.3 敏感性分析 敏感性分析表明研究结果的稳定性尚可。FokI的OR值及其95%CI变化范围为1.23(1.04,1.44)~1.38(1.18,1.60);ApaI的OR值及其95%CI变化范围为0.86(0.69,1.06)~0.97(0.87,1.08);BsmI的OR值及其95%CI变化范围为1.11(0.80,1.52)~1.32(0.95,1.83);TaqI的OR值及其95%CI变化范围为1.06(0.87,1.28)~1.20(0.97,1.47)。

2.4 Meta回归分析 将研究时间、人种、样本量、病例组对照组人数比值、病例组对照组基线是否匹配等作为协变量纳入Meta回归模型,做单个协变量的Meta回归分析,结果提示以上因素均与研究间异质性来源无关。

2.5 亚组分析 按照种族进行亚组分析。结果显示亚洲人FokI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性存在相关性〔OR=1.34,95%CI(1.09,1.65),P=0.005,见表2、图6〕。

2.6 发表偏倚的评估 漏斗图分析结果显示:ApaI、BsmI、FokI、TaqI位点单核苷酸多态性在漏斗图上左右基本对称,存在发表偏倚可能性较小(见图7~10)。Begg′s检验和Egger′s检验均未发现发表偏倚(见表3)。

3 讨论

本研究结果显示VDR基因FokI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性密切相关,等位基因f为T2DM的易患基因,与高加索人相比,亚洲人这种关联更为明显。而ApaI、 BsmI和TaqI 3个位点位点单核苷酸多态性与T2DM易患性无相关性。

表1 纳入文献基本特征

注:PCR-RFLP=限制性片段长度多态性聚合酶链反应,RT-PCR=实时荧光定量聚合酶链式反应,ADA=美国糖尿病协会,BMI=体质指数,NR=未报道;对照组HWE检测☆P<0.05

VDR基因位于12号染色体长臂1区3带1亚带(12q13.1),包括9个外显子和8个内含子。FokI位于5′端启动子区域内的外显子Ⅱ中,该位点单核苷酸多态性将产生两种结构不同的VDR蛋白,M4(F)VDR(424个氨基酸)和M1(f)VDR(427个氨基酸),后者转录活性降低[40-41],可能影响维生素D的含量,介导T2DM的发生。然而近年来关于FokI位点单核苷酸多态性与骨质疏松症[42]、肿瘤[43]、系统性红斑狼疮[44]等多种疾病相关性的研究结果存有争议,这可能与突变型转录活性的降低存在基因和靶细胞差别有关[45]。

Wang等[46]的研究定量分析了VDR基因多态性与糖尿病的关系,发现FokI和BsmI与T2DM存在相关性,等位基因f和B可能为T2DM的易患基因。而本研究纳入了之前未纳入的研究,尚未发现BsmI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性存在关联,这可能与BsmI基因突变为同义突变有关,而且ApaI、BsmI和TaqI三者连锁遗传,连锁不平衡可能导致BsmI成为其他潜在致病基因的遗传标记,产生间接关联[45]。

图1 文献筛选流程图

图2 ApaI位点单核苷酸多态性与T2DM相关性的Meta分析结果

Figure2 Meta-analysis of ApaI polymorphism and type 2 diabetes mellitus risk

图3 BsmI位点单核苷酸多态性与T2DM相关性的Meta分析结果

Figure3 Meta-analysis of BsmI polymorphism and type 2 diabetes mellitus risk

图4 FokI位点单核苷酸多态性与T2DM相关性的Meta分析结果

Figure4 Meta-analysis of FokI polymorphism and type 2 diabetes mellitus risk

图5 TaqI位点单核苷酸多态性与T2DM相关性的Meta分析结果

Figure5 Meta-analysis of TaqI polymorphism and type 2 diabetes mellitus risk

图6 FokI位点单核苷酸多态性与T2DM易感性关系种族亚组分析结果

Figure6 Subgroup analysis of ethnicity for FokI polymorphism and type 2 diabetes mellitus risk

表2 VDR基因多态性与T2DM易患性亚组分析结果

注:△亚组分析后,只有1篇文献研究对象为高加索人

表3 发表性偏倚检测结果

图7 ApaI位点单核苷酸多态性漏斗图

图8 BsmI位点单核苷酸多态性漏斗图

图9 FokI位点单核苷酸多态性漏斗图

图10 TaqI位点单核苷酸多态性漏斗图

亚组分析结果提示,FokI位点单核苷酸多态性与T2DM易患性的关联强度存在种族差异。可能有以下原因:(1)不同种族间等位基因分布频率不同,呈现与疾病无关的人群分层现象[47];(2)多基因遗传病各微效基因的致病效应存在人种差异;(3)亚洲患者遗传和基因致病作用更明显[48];(4)基因-基因、基因-环境交互作用存在种族差异;(5)微效基因与多基因遗传病的关联强度较低,而关联强度与样本量有关[49-50],本研究高加索人亚组的样本量少,导致一定的样本-效应偏倚。

本研究尚存在以下局限:首先,纳入的研究均为病例对照研究,基线不完全匹配,选择性偏倚难以避免;其次,原始基线数据不完整,混杂因素不能完全排除,可能夸大或者削弱基因与疾病之间的关联强度;再次,各研究间存在异质性,潜在的异质性涞源有待于进一步探究;最后,本研究未比较组间基因型分布的差异。

综上所述,本研究显示亚洲人FokI位点单核苷酸多态性与T2DM发病风险存在相关性,等位基因f为易患基因,这将有助于T2DM患者的早期筛查和个体化治疗,对其发病机制的探讨亦有重要指导意义。然而,mRNA、VDR和靶细胞水平的功能多态性分析以及VDR基因表观遗传学研究需要深入探讨;同时,采用家系分析来探索VDR基因与T2DM的关联将有助于排除基因人种分层现象对研究结果的干扰;基因-基因、基因-环境共同作用对T2DM发病的影响也有待于进一步了解。

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