环介导等温扩增技术检测鼠疫感染动物敏感性的应用性研究※

2021-12-29 12:59祁芝珍杨晓艳赵海红刘中凯
中国高原医学与生物学杂志 2021年3期
关键词:鼠疫敏感性引物

谢 辉,祁芝珍,杨晓艳,赵海红,刘中凯,李 胜,张 琪

(青海省地方病预防控制所,青海 西宁 811602)

环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是一种新型恒温核酸扩增技术,能否应用于鼠疫现场观点不一,本研究拟考察环介导等温扩增技术(LAMP)检测鼠疫实验感染动物的敏感性及检测时间,探讨在鼠疫流行现场应用LAMP技术的可行性。现将有关研究情况报告如下。

1.材料与方法

1.1 材料

试剂及仪器:LAMP引物由北京擎科生物有限公司合成,Loopamp®朗報®DNA扩增试剂盒(批号98004)、Loopamp荧光目视检测试剂盒(批号98002)由北京成志科为生物科技有限公司提供;鼠疫胶体金免疫层析试纸(批号202001)由中国人民解放军军事医学科学院微生物流行病研究所提供;中国细菌浊度标准吧管(批号2018-1)由中国药品生物制品检定所提供;恒温水浴箱ZC-22Q由杭州卓驰仪器有限公司提供。

实验动物:小白鼠、 豚鼠、大耳白兔由重庆鹏鑫生物科技有限公司西安分公司提供。

培养基:赫氏培养基由青海省地方病预防控制所培养基室提供。

1.2 方法

1.2.1 动物感染

1.2.2 鼠疫耶尔森菌反向血凝试验(RIHA):

分别取制备的脏器悬液,按照鼠疫诊断标准(WS279-2008)[1]方法进行反向血凝试验。

1.2.3 细菌检测

按照鼠疫诊断标准(WS279-2008)方法进行细菌学检测。

1.2.4 鼠疫胶体金免疫层析法(RGICA)试验

按1.2.1方法制备脏器悬液取上清液200 μL加入胶体金免疫层析试纸条检测孔内,15 min后观察结果:见两条显色带视为阳性结果,仅见一条显色带视为阴性结果。同时做空白对照。

1.2.5 模板制备

采用煮沸法,取动物脏器悬液于100 ℃水浴加热10 min,离心(12000r/min)取上清液作为DNA模板。将模板置-20 ℃冰箱保存。

1.2.6 鼠疫耶尔森菌环介导等温扩增技术(LAMP)试验

引物合成根据NCBI数据库(GenBank登录号AF350075)公布的鼠疫耶尔森菌3a基因序列,用Priner Explorer version 4在线软件设计LAMP引物,包括外引物F3、B3和内引物FIP、BIP以及相应的环引物(表1)。模板制备方法同1.2.5所示方法。

表1 引物序列

LAMP反应体系及反应条件:反应体系(25μL)包括:2×Reaction Mix.(12.5μL)、混合引物(1μL。引物浓度:F3、B3为5pmol/μL,BIP、FIP为40pmol/μL)、Bst DNA聚合酶(1μL)、DNA模板(2μL)、荧光染料(1μL)、灭菌纯水(补至25μL);使用恒温水浴加热(65℃)1 h。

2.结果

2.1 检测结果

LAMP检出率为100%,检测时间为1 h,细菌学培养检出率为100%,检测时间最短需24 h,RIHA检出率低于细菌学检验,检测时间为2 h,RGICA检出率最低,检测时间为15 min(表2)。

表2 各类动物材料检测结果

2.2 敏感性结果

表3 LAMP与RIHA法检测动物材料的敏感性试验结果

1~12是不同稀释度(40~81920)的LAMP可视化结果;13是阳性对照结果;14~15是阴性对照结果

3.讨论

为考察LAMP检测鼠疫实验感染动物的敏感性及检测时间,探讨在鼠疫流行现场应用LAMP技术的可行性,我们在研究鼠疫菌的敏感性和特异性基础上[2-3],对本研究目的进行了一系列的实验探索。RIHA试验是目前应用广泛的鼠疫诊断方法之一,资料表明该方法最低检菌量是2.5~5万个菌/mL[4],RGICA 是6万个菌/mL[5],当菌量低于2.5万个菌/mL时RIHA、RGICA检不出阳性结果,LAMP的最低检菌量是20个菌/mL[2],实验结果显示,LAMP法检测各种动物脏器的阳性符合率为100%,LAMP 检出率优于RIHA、RGICA。本试验阳性结果呈绿色,阴性对照结果为桔红色,肉眼观察结果清晰,易判断。

从检测时间来看,细菌学培养在材料新鲜情况下可做检测且检测时间最短(24h),而腐败材料或患者用过抗生素,则不能对突发的鼠疫疫情做出快速判定;RIHA试验受反应温度等条件制约,结果判定依赖检验人员专业层次及累积经验因素的限制,最快的结果需2 h;RGICA检测时间最短(15min),其方法是采用鼠疫单克隆抗体作为探针,捕捉特异性的FI抗原[6],具有较强的特异性,但敏感性不高,易漏诊[7];LAMP法的特点在于不需要特殊仪器设备,在1 h内即可观察结果,结果直观可靠,适合在野外疫区快速诊断。

本研究结果显示,LAMP技术具有高度敏感性,1 h内肉眼可判读结果,在鼠疫流行现场应用LAMP技术具有可行性。

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